En Suisse, quelques plantes génétiquement modifiées ainsi que différents produits issus de micro-organismes transgéniques sont autorisés comme denrées alimentaires ou comme composants de denrées alimentaires.

Les enzymes sont des protéines spécifiques qui accélèrent des réactions chimiques. On les utilise depuis des millénaires comme auxiliaires technologiques dans la production de denrées alimentaires. Comme exemples tirés de la pratique, on citera la chymosine (enzyme de la présure), utilisée dans la fabrication du fromage, ou les pectinases, utilisées dans la production de jus de fruits. Plus de 90 % des enzymes employées proviennent aujourd'hui de micro-organismes génétiquement modifiés. Ceuxci permettent d'obtenir des enzymes plus pures, plus efficaces et plus respectueuses de l'environnement. Des additifs, tels que les vitamines, les édulcorants, les colorants et les conservateurs proviennent de plus en plus de micro-organismes génétiquement modifiés.

Plus d'un quart de nos denrées alimentaires sont fabriquées à l'aide de micro-organismes. Comme cultures initiales (ou cultures «starter»), on utilise les levures pour la production de pain, de vin et de bière, et les bactéries d'acide lactique participent à la fabrication de yoghourt ou de choucroute. Des micro-organismes sont par ailleurs employés comme cultures de protection pour préserver de l'altération des produits frais sensibles - la viande, par exemple -, car ils bloquent la croissance de germes pathogènes. La recherche expérimente des méthodes de génie génétique pour optimiser les cultures initiales et les cultures de protection.

Depuis 1996, un soja transgénique tolérant aux herbicides est autorisé dans notre pays comme denrée alimentaire et aliment pour animaux. Des milliers d'aliments contiennent des produits à base de soja - la lécithine comme émulsifiant dans les sucreries, par exemple. Les mauvaises herbes sont responsables de gros problèmes dans la culture du soja, problèmes que l'on ne peut résoudre qu'en pulvérisant des herbicides. Pour faciliter le contrôle de ces mauvaises herbes, les techniciens génétiques ont obtenu une variété de soja insensible au glyphosate. Le glyphosate est un herbicide qui est rapidement dégradé dans le sol. Si l'on traite les champs de soja transgénique au glyphosate, les mauvaises herbes sont détruites, cependant que le soja continue à pousser. Les paysans ne doivent donc utiliser le produit qu'à partir du moment où la concurrence des mauvaises herbes devient trop forte pour les plants de soja. Le soja transgénique permet en outre une culture du sol sans labour, ce qui évite l'érosion. Ainsi l'agriculteur n'économise-t-il pas seulement du temps, de l'énergie et des produits phytosanitaires, il protège aussi l'environnement.